לאחר שהוענק לו כוח מדהים שלא לגמרי מובן לו, סוניק נשלח למחבוא בכדור הארץ וניתן לו חוק אחד: בשום אופן אל תיתן לעולם לדעת שאתה קיים. אך זו לא משימה פשוטה עבור נער במיוחד עם גישה ויכולות כשל סוניק. במהרה הוא מתגלה ע"י טום שוטר סרקסטי מעיירה קטנה ועם לב גדול. יחד הם יוצאים להרפתקה, כשבעקבותיהם ד"ר רובוטניק המטורף ויצירותיו המכאניות